Il Consorzio di Bonifica di Bradano e Metaponto opera sul comprensorio attraverso cinque sedi periferiche, organizzate in Centri Operativi .
Ciascun Centro controlla il territorio di propria competenza, ha una propria sede con uffici aperti al pubblico ed esercita le proprie attività attraverso la direzione di un Responsabile del Centro, collaboratore diretto del Capo del Servizio Gestione Assetto del Territorio.

Il Centro Operativo rappresenta l’unità territoriale funzionale deputata, di massima:

• all’attuazione dei programmi di intervento per l’esercizio e la manutenzione delle opere pubbliche di bonifica idraulica, civili, stradali e di irrigazione;
• all’organizzazione e coordinamento delle attività di turnazione, erogazione e sorveglianza dell’acqua per irrigazione;
• alla cura dei rapporti con l’utenza;
• al servizio di polizia idraulica.

Per quanto riguarda l’attuale modello organizzativo della gestione dell’esercizio irriguo, esso si è determinato per successivi adattamenti del modello iniziale basato sui centri operativi locali a base territoriale, nel rispetto della divisione naturale del territorio in aree delimitate dai fiumi sfocianti nello Jonio.
Dalla gestione diretta, sia dell’esercizio che della manutenzione, a mezzo di sorveglianti, guardiani acquaioli e operai che gestivano e controllavano i turni di adacquamento ed eseguivano tutte le manutenzioni, si è passati, a seguito della riconversione in reti tubate a pressione degli impianti irrigui, ad una gestione che, conservando il modello del centro operativo locale, affida in appalto a imprese specializzate la fornitura dei beni e dei servizi necessari per la manutenzione delle opere mantenendo, in capo alla struttura di ogni singolo centro operativo, l’esercizio della rete di distribuzione, il controllo dell’attività di manutenzione, la raccolta delle domande annuali di prenotazione, il rapporto con gli utenti.
Attualmente, la gestione delle prenotazioni irrigue è assistita da procedure informatizzate mentre, soltanto lo schema Monte Cotugno, e con utilizzo decisamente insufficiente, è attrezzato da un impianto di telegestione.